Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prss28Q924N9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prss28Q924N9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms