Protein–RNA interactions for Protein: Q91XY7

Pcdhga12, Protocadherin gamma A12, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhga12Q91XY7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdhga12Q91XY7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhga12Q91XY7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms