Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usb1Q91W78 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usb1Q91W78 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.5 ms