Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp3Q91W36 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp3Q91W36 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms