Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM1

Rnf130, E3 ubiquitin-protein ligase RNF130, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf130Q8VEM1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf130Q8VEM1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms