Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Stx18Q8VDS8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx18Q8VDS8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Stx18Q8VDS8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Stx18Q8VDS8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Stx18Q8VDS8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Stx18Q8VDS8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Stx18Q8VDS8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Stx18Q8VDS8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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