Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ccdc58Q8R3Q6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ccdc58Q8R3Q6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ccdc58Q8R3Q6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ccdc58Q8R3Q6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ccdc58Q8R3Q6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ccdc58Q8R3Q6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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