Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClmpQ8R373 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms