Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc12Q8R344 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc12Q8R344 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms