Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg10Q8R1P4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms