Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms