Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Hoxc12Q8K5B8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Hoxc12Q8K5B8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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Hoxc12Q8K5B8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Hoxc12Q8K5B8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Hoxc12Q8K5B8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Hoxc12Q8K5B8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Hoxc12Q8K5B8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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