Protein–RNA interactions for Protein: Q8K342

Rassf9, Ras association domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf9Q8K342 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rassf9Q8K342 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms