Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms