Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf3Q8K268 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms