Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nek9Q8K1R7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Nek9Q8K1R7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Nek9Q8K1R7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Nek9Q8K1R7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Nek9Q8K1R7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Nek9Q8K1R7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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