Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms