Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl11Q8CE33 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klhl11Q8CE33 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klhl11Q8CE33 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klhl11Q8CE33 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klhl11Q8CE33 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klhl11Q8CE33 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl11Q8CE33 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl11Q8CE33 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl11Q8CE33 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl11Q8CE33 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl11Q8CE33 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl11Q8CE33 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl11Q8CE33 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl11Q8CE33 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl11Q8CE33 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl11Q8CE33 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl11Q8CE33 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl11Q8CE33 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl11Q8CE33 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl11Q8CE33 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl11Q8CE33 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl11Q8CE33 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl11Q8CE33 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl11Q8CE33 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl11Q8CE33 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl11Q8CE33 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl11Q8CE33 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl11Q8CE33 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl11Q8CE33 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms