Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDU6

Hectd2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD2, mousemouse

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd2Q8CDU6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hectd2Q8CDU6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hectd2Q8CDU6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms