Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CrebrfQ8CDG5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrebrfQ8CDG5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrebrfQ8CDG5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrebrfQ8CDG5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrebrfQ8CDG5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrebrfQ8CDG5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrebrfQ8CDG5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrebrfQ8CDG5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrebrfQ8CDG5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrebrfQ8CDG5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrebrfQ8CDG5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrebrfQ8CDG5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrebrfQ8CDG5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrebrfQ8CDG5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrebrfQ8CDG5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrebrfQ8CDG5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CrebrfQ8CDG5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CrebrfQ8CDG5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CrebrfQ8CDG5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms