Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCT7

Nsun3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun3Q8CCT7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nsun3Q8CCT7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsun3Q8CCT7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsun3Q8CCT7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsun3Q8CCT7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsun3Q8CCT7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsun3Q8CCT7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsun3Q8CCT7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nsun3Q8CCT7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms