Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacnb2Q8CC27 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacnb2Q8CC27 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb2Q8CC27 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb2Q8CC27 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb2Q8CC27 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb2Q8CC27 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb2Q8CC27 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb2Q8CC27 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb2Q8CC27 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb2Q8CC27 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb2Q8CC27 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb2Q8CC27 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb2Q8CC27 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb2Q8CC27 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb2Q8CC27 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb2Q8CC27 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb2Q8CC27 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb2Q8CC27 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb2Q8CC27 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb2Q8CC27 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms