Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Lrrn3Q8CBC6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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