Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Atg4aQ8C9S8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Atg4aQ8C9S8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg4aQ8C9S8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg4aQ8C9S8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg4aQ8C9S8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Atg4aQ8C9S8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg4aQ8C9S8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg4aQ8C9S8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Atg4aQ8C9S8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg4aQ8C9S8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Atg4aQ8C9S8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Atg4aQ8C9S8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Atg4aQ8C9S8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Atg4aQ8C9S8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg4aQ8C9S8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg4aQ8C9S8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Atg4aQ8C9S8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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