Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8K6

Atxn7l2, Ataxin 7-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l2Q8C8K6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atxn7l2Q8C8K6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l2Q8C8K6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms