Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms