Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7D2

Crbn, Protein cereblon, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrbnQ8C7D2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CrbnQ8C7D2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CrbnQ8C7D2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CrbnQ8C7D2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CrbnQ8C7D2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CrbnQ8C7D2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CrbnQ8C7D2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CrbnQ8C7D2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CrbnQ8C7D2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CrbnQ8C7D2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CrbnQ8C7D2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CrbnQ8C7D2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CrbnQ8C7D2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CrbnQ8C7D2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CrbnQ8C7D2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CrbnQ8C7D2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms