Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe22Q8C6A8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms