Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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Ubqln3Q8C5U9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubqln3Q8C5U9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubqln3Q8C5U9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubqln3Q8C5U9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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Ubqln3Q8C5U9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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Ubqln3Q8C5U9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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Ubqln3Q8C5U9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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Ubqln3Q8C5U9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubqln3Q8C5U9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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Ubqln3Q8C5U9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Ubqln3Q8C5U9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubqln3Q8C5U9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Ubqln3Q8C5U9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Ubqln3Q8C5U9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Ubqln3Q8C5U9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Ubqln3Q8C5U9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubqln3Q8C5U9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubqln3Q8C5U9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Ubqln3Q8C5U9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubqln3Q8C5U9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubqln3Q8C5U9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubqln3Q8C5U9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubqln3Q8C5U9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubqln3Q8C5U9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubqln3Q8C5U9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubqln3Q8C5U9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubqln3Q8C5U9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubqln3Q8C5U9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubqln3Q8C5U9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubqln3Q8C5U9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubqln3Q8C5U9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubqln3Q8C5U9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubqln3Q8C5U9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubqln3Q8C5U9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubqln3Q8C5U9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ubqln3Q8C5U9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Ubqln3Q8C5U9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms