Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cwc22Q8C5N3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms