Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Hdac7Q8C2B3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac7Q8C2B3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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