Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q2

Zhx3, Zinc fingers and homeoboxes protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zhx3Q8C0Q2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zhx3Q8C0Q2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zhx3Q8C0Q2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zhx3Q8C0Q2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zhx3Q8C0Q2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zhx3Q8C0Q2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zhx3Q8C0Q2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zhx3Q8C0Q2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zhx3Q8C0Q2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zhx3Q8C0Q2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zhx3Q8C0Q2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zhx3Q8C0Q2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zhx3Q8C0Q2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zhx3Q8C0Q2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zhx3Q8C0Q2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zhx3Q8C0Q2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zhx3Q8C0Q2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zhx3Q8C0Q2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zhx3Q8C0Q2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zhx3Q8C0Q2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zhx3Q8C0Q2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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