Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp5Q8BX09 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms