Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pggt1bQ8BUY9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Pggt1bQ8BUY9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Pggt1bQ8BUY9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pggt1bQ8BUY9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms