Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43Q8BUM9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp43Q8BUM9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp43Q8BUM9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms