Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cep55Q8BT07 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cep55Q8BT07 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms