Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSK8

Rps6kb1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb1Q8BSK8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rps6kb1Q8BSK8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps6kb1Q8BSK8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms