Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQU3

Sdhaf3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdhaf3Q8BQU3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdhaf3Q8BQU3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms