Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms