Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpc2Q8BKV1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpc2Q8BKV1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms