Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms