Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms