Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Htatsf1Q8BGC0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms