Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pknox2Q8BG99 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pknox2Q8BG99 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pknox2Q8BG99 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pknox2Q8BG99 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pknox2Q8BG99 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pknox2Q8BG99 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pknox2Q8BG99 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pknox2Q8BG99 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pknox2Q8BG99 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pknox2Q8BG99 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pknox2Q8BG99 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pknox2Q8BG99 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pknox2Q8BG99 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pknox2Q8BG99 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pknox2Q8BG99 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pknox2Q8BG99 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pknox2Q8BG99 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pknox2Q8BG99 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pknox2Q8BG99 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pknox2Q8BG99 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pknox2Q8BG99 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms