Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfascQ810U3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms