Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Liat1Q810M6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms