Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
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