Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rbbp8Q80YR6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms