Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Kdm5bQ80Y84 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5bQ80Y84 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms