Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ttc29Q80VM3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ttc29Q80VM3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ttc29Q80VM3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc29Q80VM3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms